首先要安装mysql驱动程序包
Step 1: 将mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar文件拷贝到......\MATLAB\R2009a\java\jar\toolbox
Step 2: 到......\MATLAB\R2009a\toolbox\local目录下,找到classpath.txt文件,打开,并添加用来加载mysql的jdbc驱动语句:
$matlabroot/java/jar/toolbox/mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar
Step 3:重新打开MATLAB即可
驱动程序安装成功后,接来下要是matlab连接mysql数据库的代码:
conn =database('databasename','username','password','driver','databaseurl')
连接成功后,返回连接对象。
参数如下:
*databasename: 数据库名称.
*driver: JDBC driver.
*username and password: 用户名和密码.
*databaseurl: 类似于jdbc:subprotocol:subname. subprotocol 是数据库类型,
subname 类似于//hostname:port/databasename.
如果matlab和数据库建立了连接,将返回类似于如下信息:
Instance: 'SampleDB'
UserName: ''
Driver: []
URL: []
Constructor: [1x1 com.mathworks.toolbox.database.databaseConnect]
Message: []
Handle: [1x1 sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcConnection]
TimeOut: 0
AutoCommit: 'off'
Type: 'Database Object'
连接mysql的代码如下:
conn = database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.Driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi');
连接成功后,就可以用exec函数执行sql语句
exec函数执行sql语句并返回一个开指针
语法如下:
curs = exec(conn,'sqlquery')
例如:curs = exec(conn, 'select * from customers')
执行完查询后,还要将查询结果从开放cursor对象导入到对象curs中,该功能是用
cursor.fetch函数实现的。
语法如下:
curs = fetch(curs)
使用curs.Data来显示数据,curs.Data返回一个CELL结构,可以先把CELL结构转换成
MATRIX结构再取值:
cur =cell2mat(cur)
a=cur(1,1);
则查询结果就加到了向量a中
注意:
在exec函数执行查询过程中,有的sql语句要输入变量,这时可使用strcat函数完成该
功能。
t = strcat(s1, s2, s3, ...)
for(t=1:10)
sql1 = strcat('select count(did) from rss_genepairs_u where gocc=',num2str(t),' || gomf = ',num2str(t),' || gobp = ',num2str(t));
end
完整代码如下:
conn = database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.Driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi');
for t=0.5:0.01:0.91
for x=0.5:0.1:11
sql = strcat('select count(did) from rss_genepairs_x2 where score =',num2str(x),' and did in(select did from rss_genepairs_u where gocc =',num2str(t),' || gomf = ',num2str(t),' || gobp = ',num2str(t),')');
aTemp = exec(conn,sql);
aTemp = fetch(aTemp);
a = aTemp.Data;
a = cell2mat(a);
a= a(1,1);
end
end
首先要安装mysql驱动程序包
Step 1: 将mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar文件拷贝到......\MATLAB\R2009a\java\jar\toolbox
Step 2: 到......\MATLAB\R2009a\toolbox\local目录下,找到classpath.txt文件,打开,并添加用来加载mysql的jdbc驱动语句:
$matlabroot/java/jar/toolbox/mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar
Step 3:重新打开MATLAB即可
驱动程序安装成功后,接来下要是matlab连接mysql数据库的代码:
conn =database('databasename','username','password','driver','databaseurl')
连接成功后,返回连接对象。
参数如下:
*databasename: 数据库名称.
*driver: JDBC driver.
*username and password: 用户名和密码.
*databaseurl: 类似于jdbc:subprotocol:subname. subprotocol 是数据库类型,
subname 类似于//hostname:port/databasename.
如果matlab和数据库建立了连接,将返回类似于如下信息:
Instance: 'SampleDB'
UserName: ''
Driver: []
URL: []
Constructor: [1x1 com.mathworks.toolbox.database.databaseConnect]
Message: []
Handle: [1x1 sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcConnection]
TimeOut: 0
AutoCommit: 'off'
Type: 'Database Object'
连接mysql的代码如下:
conn = database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.Driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi');
连接成功后,就可以用exec函数执行sql语句
exec函数执行sql语句并返回一个开指针
语法如下:
curs = exec(conn,'sqlquery')
例如:curs = exec(conn, 'select * from customers')
执行完查询后,还要将查询结果从开放cursor对象导入到对象curs中,该功能是用
cursor.fetch函数实现的。
语法如下:
curs = fetch(curs)
使用curs.Data来显示数据,curs.Data返回一个CELL结构,可以先把CELL结构转换成
MATRIX结构再取值:
cur =cell2mat(cur)
a=cur(1,1);
则查询结果就加到了向量a中
注意:
在exec函数执行查询过程中,有的sql语句要输入变量,这时可使用strcat函数完成该
功能。
t = strcat(s1, s2, s3, ...)
for(t=1:10)
sql1 = strcat('select count(did) from rss_genepairs_u where gocc=',num2str(t),' || gomf = ',num2str(t),' || gobp = ',num2str(t));
end
完整代码如下:
conn = database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.Driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi');
for t=0.5:0.01:0.91
for x=0.5:0.1:11
sql = strcat('select count(did) from rss_genepairs_x2 where score =',num2str(x),' and did in(select did from rss_genepairs_u where gocc =',num2str(t),' || gomf = ',num2str(t),' || gobp = ',num2str(t),')');
aTemp = exec(conn,sql);
aTemp = fetch(aTemp);
a = aTemp.Data;
a = cell2mat(a);
a= a(1,1);
end
end
一、使用Windows系统自带的数据源工具创建基于Access的数据库。具体步骤是:控制面板--》管理工具--》数据源(ODBC)---》用户DSN--》添加。创建数据源SampleDB。
二、在Matlab中连接ODBC数据源:可以使用database工具箱或者代码编程的方式,下面介绍编程的方式
1、连接数据库:
conn=database( 'SampleDB' , '' , '' )
2、测试数据库是否连接成功
ping(conn)
3、打开游标,并把执行SQL语句
cursor = exec(conn,'select * from PeopleInfo')
4、读取数据,可以从游标中读取,也可直接读取
result=fetch(cursor)
5、关闭游标和链接
close(cursor)
close(conn)
备注:上面是采用cursor.fetch的方式,也可采用database.fetch的方式
conn=database(...)
result=fetch(conn, sqlquery)
而cursor.fetch 的编码方式是:
conn=database(...)
curs=exec(conn, sqlquery)
curs=fetch(curs)
result = curs.Data
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